Сайт MIT (http://mit.edu/) тоже не сильно блещет дизайном, однако это отнюдь не мешает этому университету оставаться одним из ведущих в мире в области технологий.
Корень проблемы следует искать в подготовке кадров, которые делают эти самые сайты. Ведь никто не рассказывает студентам даже двух слов о дизайне и юзабилити. Ну и, видимо, в поощрениях, поскольку все люди, способные сделать хоть что-то похожее на вещь, не будут работать на факультет, а пойдут зарабатывать денюжку на стороне.