Сегодня удалось сделать маленькое чудо - LogMeIn подхватил Java машину в фаерфоксе под убунтой и спокойно запустил окно с джава-апплетом для удаленного доступа. Не так красиво как в случае Active-X под виндой, но и не статичная картинка, как было раньше.