cd /home/mysql

ls -l

вау .... 10Gb байнари логов  от mysql:(

...
webber-bin.009
webber-bin.010
webber-bin.011
....

вот такого плана файлов насобиралась за два года большущая куча. Что внутри? Внутри все операции, которые происходили с базами, т.н. "binary log", назначение которого, в случае чего, восстановить базу "пошагово" до нужного нам состояния. Но если у нас все ок, база жива, а место становится все меньше и меньше, то мы можем корректно подчистить лог без зазрения совести.

подключаемся к mysql:

mysql -urootuser -p и выполняем такую команду:

reset master;

после чего выходим из mysql и убеждаемся в отсутствии логов и присутствии места. Операцию можно добавить в periodic monthly.