Рекомендую воспользоваться системой для резервного копирования Veritas Backup Exec и опционалом SharePoint Portal, связкой, которой пользуюсь сам. Sharepoint абсолютно все настройки и данные держит в базе. По большому счету необходимо и достаточно копировать базы портала средствами самого MS SQL.
